Jean Clottes is the author of Documentation, recherche, publication et conservation. La collaboration internationale (1993), Les grottes ornées pyrenéennes (Midi-Pyrenées) (1990), Le Paléolithique supérieur dans les Pyrénées françaises (1974), Dolmens et menhirs du Midi (1987), Inventaire des gisements préhistoriques du département du Lot (1969).